Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 MYO18A-205ENST00000529578 2667 ntTSL 29.89□□□□□ -0.834e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.844e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.887e-8■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 HDHD3-203ENST00000485934 913 ntTSL 29.48□□□□□ -0.894e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.94e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 IP6K1-201ENST00000321599 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.914e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 AKR1B10-201ENST00000359579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.946e-8■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FP700125.1-201ENST00000628622 3262 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.994e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FTX-215ENST00000638681 9771 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.014e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.034e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 CDC14B-204ENST00000412285 5271 ntTSL 1 (best)8.49□□□□□ -1.054e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 AKR1B10-202ENST00000475559 869 ntTSL 58.18□□□□□ -1.16e-8■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FTX-211ENST00000603672 1077 ntTSL 57.9□□□□□ -1.144e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FTX-209ENST00000602812 2356 ntTSL 1 (best)7.71□□□□□ -1.174e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.184e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.224e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 MYO18A-201ENST00000527312 573 ntTSL 26.35□□□□□ -1.394e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 MYO18A-211ENST00000531438 565 ntTSL 46.18□□□□□ -1.424e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 SLC23A2-203ENST00000423430 911 ntTSL 56.13□□□□□ -1.434e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.774e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FTX-206ENST00000602420 751 ntTSL 33.8□□□□□ -1.84e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 CDC14B-213ENST00000496750 649 ntTSL 33.68□□□□□ -1.824e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 FTX-218ENST00000641360 3897 nt3.2□□□□□ -1.94e-6■□□□□ 8.5
SRSF9Q13242 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC10.83□□□□□ -0.684e-9■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 APLP2-224ENST00000534582 556 ntTSL 512.98□□□□□ -0.332e-11■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 APLP2-225ENST00000534761 551 ntTSL 510.39□□□□□ -0.752e-11■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RBMX-204ENST00000464781 1852 ntTSL 29.94□□□□□ -0.823e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RBMX-201ENST00000320676 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.923e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RBMX-210ENST00000565907 563 ntTSL 29□□□□□ -0.973e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.123e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RBMX-212ENST00000568578 4887 ntTSL 1 (best)7.56□□□□□ -1.23e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RBMX-208ENST00000563370 577 ntTSL 37.51□□□□□ -1.213e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RBMX-211ENST00000567262 477 ntTSL 57.51□□□□□ -1.213e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 NHSL1-201ENST00000342260 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.09□□□□□ -1.273e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RBMX-207ENST00000562646 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.293e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.351e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RBMX-202ENST00000419968 940 ntTSL 55.76□□□□□ -1.493e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 OGT-210ENST00000488174 7243 ntTSL 55.4□□□□□ -1.541e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 OGT-204ENST00000455587 632 ntTSL 35.33□□□□□ -1.561e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.581e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.743e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.94□□□□□ -2.263e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.081e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 ACAP3-212ENST00000492936 5319 ntTSL 1 (best)15.2■□□□□ 0.021e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 FASTK-213ENST00000482806 1826 ntTSL 514.94□□□□□ -0.021e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 ACAP3-210ENST00000478065 2393 ntTSL 314.63□□□□□ -0.071e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.081e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 FASTK-215ENST00000489884 1751 ntTSL 1 (best)14.29□□□□□ -0.121e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.131e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.141e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.151e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 UBA5-209ENST00000480955 894 ntTSL 213.93□□□□□ -0.181e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 UBA5-204ENST00000464101 570 ntTSL 213.87□□□□□ -0.191e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 FASTK-216ENST00000496663 818 ntTSL 213.56□□□□□ -0.241e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.251e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 ACAP3-208ENST00000472541 1946 ntTSL 513.25□□□□□ -0.291e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 FASTK-205ENST00000461979 720 ntTSL 513.11□□□□□ -0.311e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 UBA5-214ENST00000505777 576 ntTSL 413.07□□□□□ -0.321e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.361e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.511e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.551e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.571e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 FASTK-204ENST00000460980 1521 ntTSL 510.57□□□□□ -0.721e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 SLCO4A1-207ENST00000495889 543 ntTSL 310.48□□□□□ -0.731e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 WDR6-212ENST00000472878 556 ntTSL 510.28□□□□□ -0.761e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 ACAP3-211ENST00000479108 485 ntTSL 39.48□□□□□ -0.891e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 WDR6-209ENST00000461687 555 ntTSL 49.44□□□□□ -0.91e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 UBA5-205ENST00000468022 662 ntTSL 59.43□□□□□ -0.91e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 SLCO4A1-205ENST00000466961 819 ntTSL 38.94□□□□□ -0.981e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 WDR6-215ENST00000489427 564 ntTSL 48.56□□□□□ -1.041e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 ACAP3-203ENST00000354980 582 ntTSL 58.54□□□□□ -1.041e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 SLCO4A1-203ENST00000451793 856 ntTSL 28.19□□□□□ -1.11e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 SLCO4A1-206ENST00000470412 986 ntTSL 57.17□□□□□ -1.261e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 WDR6-203ENST00000419837 538 ntTSL 46.84□□□□□ -1.311e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 ACAP3-205ENST00000438966 265 ntTSL 34.58□□□□□ -1.681e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -21e-7■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RAB11FIP3-209ENST00000483002 585 ntTSL 410.28□□□□□ -0.762e-10■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RAB11FIP3-202ENST00000412256 558 ntTSL 28.65□□□□□ -1.022e-10■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RAB11FIP3-204ENST00000449879 580 ntTSL 310.28□□□□□ -0.763e-6■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 RAB11FIP3-206ENST00000452814 804 ntTSL 59.74□□□□□ -0.853e-6■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.948e-30■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.398e-30■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.188e-30■□□□□ 8.3
SRSF9Q13242 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.817e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.47e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 AKAP8L-203ENST00000594594 2251 ntTSL 517.14■□□□□ 0.337e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-205ENST00000467980 899 ntTSL 316.28■□□□□ 0.27e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.197e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.187e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-215ENST00000439101 779 ntTSL 516.13■□□□□ 0.177e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.177e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-209ENST00000424537 781 ntTSL 215.92■□□□□ 0.147e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-206ENST00000469309 910 ntTSL 215.26■□□□□ 0.037e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 MIDN-202ENST00000586757 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.06■□□□□ 07e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.057e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.17e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-215ENST00000495535 672 ntTSL 314.44□□□□□ -0.17e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 REPIN1-219ENST00000522266 480 ntTSL 214.44□□□□□ -0.17e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.177e-6■□□□□ 8.2
SRSF9Q13242 AKAP8L-220ENST00000609519 2113 ntTSL 213.79□□□□□ -0.27e-6■□□□□ 8.2
Retrieved 100 of 3,885 protein–RNA pairs in 16.6 ms