Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME3Q13232 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME3Q13232 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NME3Q13232 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME3Q13232 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME3Q13232 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME3Q13232 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME3Q13232 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME3Q13232 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME3Q13232 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME3Q13232 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME3Q13232 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME3Q13232 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME3Q13232 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME3Q13232 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME3Q13232 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME3Q13232 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME3Q13232 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NME3Q13232 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NME3Q13232 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME3Q13232 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME3Q13232 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME3Q13232 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME3Q13232 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME3Q13232 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NME3Q13232 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME3Q13232 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME3Q13232 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME3Q13232 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME3Q13232 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME3Q13232 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME3Q13232 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME3Q13232 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME3Q13232 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME3Q13232 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME3Q13232 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME3Q13232 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NME3Q13232 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME3Q13232 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME3Q13232 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME3Q13232 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME3Q13232 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME3Q13232 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME3Q13232 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME3Q13232 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME3Q13232 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME3Q13232 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME3Q13232 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME3Q13232 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME3Q13232 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME3Q13232 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME3Q13232 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME3Q13232 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NME3Q13232 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NME3Q13232 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME3Q13232 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME3Q13232 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME3Q13232 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME3Q13232 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME3Q13232 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME3Q13232 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME3Q13232 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME3Q13232 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME3Q13232 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NME3Q13232 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME3Q13232 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME3Q13232 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME3Q13232 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME3Q13232 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NME3Q13232 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME3Q13232 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME3Q13232 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME3Q13232 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME3Q13232 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME3Q13232 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME3Q13232 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME3Q13232 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME3Q13232 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME3Q13232 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NME3Q13232 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME3Q13232 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME3Q13232 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME3Q13232 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NME3Q13232 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME3Q13232 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME3Q13232 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME3Q13232 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME3Q13232 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME3Q13232 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NME3Q13232 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NME3Q13232 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME3Q13232 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME3Q13232 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME3Q13232 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NME3Q13232 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME3Q13232 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME3Q13232 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME3Q13232 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME3Q13232 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME3Q13232 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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