Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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ERCC8Q13216 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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ERCC8Q13216 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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ERCC8Q13216 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERCC8Q13216 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ERCC8Q13216 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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