Protein–RNA interactions for Protein: Q13206

DDX10, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX10Q13206 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DDX10Q13206 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DDX10Q13206 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
DDX10Q13206 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDX10Q13206 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms