Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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MRPL28Q13084 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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MRPL28Q13084 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MRPL28Q13084 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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MRPL28Q13084 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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MRPL28Q13084 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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MRPL28Q13084 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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MRPL28Q13084 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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MRPL28Q13084 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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MRPL28Q13084 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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MRPL28Q13084 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MRPL28Q13084 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms