Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMARCB1Q12824 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCB1Q12824 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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