Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 YIL161WYIL161W 708 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 SOP4YJL192C 705 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YJR037WYJR037W 384 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 MCM22YJR135C 720 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YNL285WYNL285W 372 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 ERV15YBR210W 429 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 GPA2YER020W 1350 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 HSF1YGL073W 2502 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 STE13YOR219C 2796 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YDR109CYDR109C 2148 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 GSY2YLR258W 2118 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 POL31YJR006W 1464 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 LSG1YGL099W 1923 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 OST1YJL002C 1431 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 JJJ1YNL227C 1773 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 MKK2YPL140C 1521 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 NUS1YDL193W 1128 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 IZH1YDR492W 951 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 HUR1YGL168W 333 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 SIP2YGL208W 1248 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YPT35YHR105W 645 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 snR41snR41 95 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 APE3YBR286W 1614 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 HCA4YJL033W 2313 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 SSK1YLR006C 2139 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 RGP1YDR137W 1992 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YCL075WYCL075W 441 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YER087C-AYER087C-A 552 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 THI5YFL058W 1023 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 CDC12YHR107C 1224 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 TDH2YJR009C 999 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YLR171WYLR171W 390 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 RRN9YMR270C 1098 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YMR295CYMR295C 594 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 SVS1YPL163C 783 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 VPS17YOR132W 1656 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 RET1YOR207C 3450 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 ESA1YOR244W 1338 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 GAS4YOL132W 1416 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 DSE1YER124C 1722 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 DDC1YPL194W 1839 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 STR2YJR130C 1920 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YCL076WYCL076W 744 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YER079WYER079W 633 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 PUG1YER185W 912 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 PET54YGR222W 882 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 SPO13YHR014W 876 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 VMA22YHR060W 546 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 SPL2YHR136C 447 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YIL029CYIL029C 429 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YKL223WYKL223W 333 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 UBI4YLL039C 1146 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 ERD2YBL040C 660 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 SUA7YPR086W 1038 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 ASH1YKL185W 1767 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 RIM101YHL027W 1878 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YML082WYML082W 1950 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 SAC6YDR129C 1929 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 RRP3YHR065C 1506 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 DAS1YJL149W 1992 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 VMS1YDR049W 1899 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 SMF2YHR050W 1650 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YMR111CYMR111C 1389 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 snR9snR9 187 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 SEC20YDR498C 1152 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 APA2YDR530C 978 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 LOC1YFR001W 615 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YGL072CYGL072C 360 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 TOS8YGL096W 831 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 COX13YGL191W 390 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YGR039WYGR039W 312 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 SLX9YGR081C 633 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YHL018WYHL018W 363 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 FYV4YHR059W 393 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 RRP4YHR069C 1080 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YHR138CYHR138C 345 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YAP5YIR018W 738 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 MOH1YBL049W 417 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 ATP11YNL315C 957 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 SCS22YBL091C-A 528 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 SFM1YOR021C 642 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 PEP12YOR036W 867 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YOR387CYOR387C 621 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 YDL109CYDL109C 1944 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 UTP4YDR324C 2331 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 PHR1YOR386W 1698 nt5.21□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 TRP5YGL026C 2124 nt5.21□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 FHL1YPR104C 2811 nt5.21□□□□□ -1.57
TY1A-NL1Q12391 EMW1YNL313C 2715 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 TEL2YGR099W 2067 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 THO1YER063W 657 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YER068C-AYER068C-A 432 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YER085CYER085C 522 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 MIG2YGL209W 1149 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 LRP1YHR081W 555 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 YNL043CYNL043C 321 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1A-NL1Q12391 TPM1YNL079C 600 nt5.21□□□□□ -1.58
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