Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 BUD16YEL029C 939 nt4.2□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 IMP3YHR148W 552 nt4.2□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt4.2□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 NIT3YLR351C 876 nt4.2□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 CPR3YML078W 549 nt4.2□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 AAH1YNL141W 1044 nt4.2□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt4.2□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 UBP6YFR010W 1500 nt4.2□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 TFA1YKL028W 1449 nt4.2□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 TRM13YOL125W 1431 nt4.2□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 CMK1YFR014C 1341 nt4.2□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 TAF6YGL112C 1551 nt4.19□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 DPB4YDR121W 591 nt4.19□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 PAD1YDR538W 729 nt4.19□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 LAC1YKL008C 1257 nt4.19□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 MOH1YBL049W 417 nt4.19□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 YIP3YNL044W 531 nt4.19□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 ATG19YOL082W 1248 nt4.19□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 DER1YBR201W 636 nt4.19□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 YBR219CYBR219C 384 nt4.19□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 KAR1YNL188W 1302 nt4.19□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 TCA17YEL048C 459 nt4.18□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt4.18□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 GEP4YHR100C 558 nt4.18□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 RPC17YJL011C 486 nt4.18□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 ENT3YJR125C 1227 nt4.18□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 TEX1YNL253W 1269 nt4.18□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt4.18□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 YBR089WYBR089W 600 nt4.18□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 SHE3YBR130C 1278 nt4.18□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 YOL019WYOL019W 1656 nt4.18□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 MYO3YKL129C 3819 nt4.18□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 TYR1YBR166C 1359 nt4.17□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 ARI1YGL157W 1044 nt4.17□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 YGR168CYGR168C 1131 nt4.17□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 PPE1YHR075C 1203 nt4.17□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 UPS2YLR168C 693 nt4.17□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 YLR198CYLR198C 360 nt4.17□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 RPS1BYML063W 768 nt4.17□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 MVD1YNR043W 1191 nt4.17□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 SET6YPL165C 1122 nt4.17□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 CMR3YPR013C 954 nt4.17□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 BOI2YER114C 3123 nt4.17□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 YLR352WYLR352W 2424 nt4.16□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 ENT1YDL161W 1365 nt4.16□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 YRM1YOR172W 2361 nt4.16□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 RRG1YDR065W 1098 nt4.16□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 YDR124WYDR124W 975 nt4.16□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 DDI2YFL061W 678 nt4.16□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 DDI3YNL335W 678 nt4.16□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 RIT1YMR283C 1542 nt4.16□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 FMP30YPL103C 1407 nt4.15□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 RAD54YGL163C 2697 nt4.15□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 SEG1YMR086W 2883 nt4.15□□□□□ -1.74
LSP1Q12230 FCF1YDR339C 570 nt4.15□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 SPI1YER150W 447 nt4.15□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 FMP10YER182W 735 nt4.15□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 FSH1YHR049W 732 nt4.15□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 VMA22YHR060W 546 nt4.15□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 YNL181WYNL181W 1224 nt4.15□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 RPN8YOR261C 1017 nt4.15□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 SPN1YPR133C 1233 nt4.15□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 FRM2YCL026C-A 582 nt4.15□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 DHR2YKL078W 2208 nt4.15□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 SPT10YJL127C 1923 nt4.15□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 MSS2YDL107W 1056 nt4.14□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 KEG1YFR042W 603 nt4.14□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 CAP2YIL034C 864 nt4.14□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 GMH1YKR030W 822 nt4.14□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 YBL010CYBL010C 843 nt4.14□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 YML090WYML090W 387 nt4.14□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 YBL094CYBL094C 333 nt4.14□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 AIM39YOL053W 1188 nt4.14□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 VPS21YOR089C 633 nt4.14□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 SCD6YPR129W 1050 nt4.14□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 PEX34YCL056C 435 nt4.14□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 THR4YCR053W 1545 nt4.14□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 MRPL32YCR003W 552 nt4.13□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 CLC1YGR167W 702 nt4.13□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 TMA19YKL056C 504 nt4.13□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 SIC1YLR079W 855 nt4.13□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 FLD1YLR404W 858 nt4.13□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 RRP36YOR287C 903 nt4.13□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 HPR1YDR138W 2259 nt4.12□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 CIT1YNR001C 1440 nt4.12□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 SPA2YLL021W 4401 nt4.12□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 YCR050CYCR050C 309 nt4.12□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 YDR290WYDR290W 330 nt4.12□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 YFL065CYFL065C 309 nt4.12□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt4.12□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt4.12□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt4.12□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 YGL193CYGL193C 312 nt4.12□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 SOD1YJR104C 465 nt4.12□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 NSE1YLR007W 1011 nt4.12□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 IAH1YOR126C 717 nt4.12□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 CNS1YBR155W 1158 nt4.12□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 GLN4YOR168W 2430 nt4.12□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 HEF3YNL014W 3135 nt4.12□□□□□ -1.75
LSP1Q12230 SOF1YLL011W 1470 nt4.11□□□□□ -1.75
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