Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	VPS21	YOR089C	633 nt		3.55	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	YPR108W-A	YPR108W-A	213 nt		3.55	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	CTR1	YPR124W	1221 nt		3.55	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	RAD4	YER162C	2265 nt		3.55	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	PWP2	YCR057C	2772 nt		3.55	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	TGL1	YKL140W	1647 nt		3.55	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	YCR101C	YCR101C	549 nt		3.54	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	YDR282C	YDR282C	1245 nt		3.54	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	SPT3	YDR392W	1014 nt		3.54	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	IRC25	YLR021W	540 nt		3.54	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	CDC73	YLR418C	1182 nt		3.54	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	TVP18	YMR071C	504 nt		3.54	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	IST1	YNL265C	897 nt		3.54	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	WRS1	YOL097C	1299 nt		3.54	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	YPL162C	YPL162C	822 nt		3.54	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	MNR2	YKL064W	2910 nt		3.54	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	TSR1	YDL060W	2367 nt		3.53	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	MCM21	YDR318W	1107 nt		3.53	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	YKT6	YKL196C	603 nt		3.53	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	GPI1	YGR216C	1830 nt		3.53	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	KIN4	YOR233W	2403 nt		3.53	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	YPS7	YDR349C	1791 nt		3.53	□□□□□ -1.84
VIK1	Q12045	ROD1	YOR018W	2514 nt		3.52	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	RKM3	YBR030W	1659 nt		3.52	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	FLO9	YAL063C	3969 nt		3.52	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	RPB7	YDR404C	516 nt		3.52	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	EDC1	YGL222C	528 nt		3.52	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	DPH1	YIL103W	1278 nt		3.52	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	BAT2	YJR148W	1131 nt		3.52	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	COQ5	YML110C	924 nt		3.52	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	YMR010W	YMR010W	1218 nt		3.52	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	YBL077W	YBL077W	432 nt		3.52	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	MPD1	YOR288C	957 nt		3.52	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	RSF2	YJR127C	4143 nt		3.52	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	TED1	YIL039W	1422 nt		3.52	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	FRT2	YAL028W	1587 nt		3.51	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	PEX1	YKL197C	3132 nt		3.51	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	STE14	YDR410C	720 nt		3.51	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	USE1	YGL098W	738 nt		3.51	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	SFH5	YJL145W	885 nt		3.51	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	YKL162C-A	YKL162C-A	153 nt		3.51	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	MSA2	YKR077W	1092 nt		3.51	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	YLR225C	YLR225C	1224 nt		3.51	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	RAD33	YML011C	534 nt		3.51	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	RIM11	YMR139W	1113 nt		3.51	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	MIH1	YMR036C	1665 nt		3.51	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	PPQ1	YPL179W	1650 nt		3.51	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	ETP1	YHL010C	1758 nt		3.51	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	YCR075W-A	YCR075W-A	228 nt		3.5	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	TMA17	YDL110C	453 nt		3.5	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	SDT1	YGL224C	843 nt		3.5	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	ERD2	YBL040C	660 nt		3.5	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	RPS9B	YBR189W	588 nt		3.5	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	RNR1	YER070W	2667 nt		3.5	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	NUP85	YJR042W	2235 nt		3.5	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	CDC45	YLR103C	1953 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	BYE1	YKL005C	1785 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	PUF2	YPR042C	3228 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	KAP95	YLR347C	2586 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	BUD30	YDL151C	582 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	VFA1	YER128W	612 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	PUG1	YER185W	912 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	YGL101W	YGL101W	648 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	CDC8	YJR057W	651 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	DDP1	YOR163W	567 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	PEP4	YPL154C	1218 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	SEA4	YBL104C	3117 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	NRP1	YDL167C	2160 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	SSU1	YPL092W	1377 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	SEC6	YIL068C	2418 nt		3.49	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	SPO1	YNL012W	1896 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	FUN12	YAL035W	3009 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	NAT1	YDL040C	2565 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	YEL025C	YEL025C	3567 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	MGT1	YDL200C	567 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	RPS18A	YDR450W	441 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	ENT3	YJR125C	1227 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	MET16	YPR167C	786 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	snR34	snR34	203 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	RPN2	YIL075C	2838 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	TCB3	YML072C	4638 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	STB3	YDR169C	1542 nt		3.48	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	DUO1	YGL061C	744 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	YGL118C	YGL118C	438 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	PEX12	YMR026C	1200 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	YMR084W	YMR084W	789 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	YNL057W	YNL057W	333 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	GIS2	YNL255C	462 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	VPS28	YPL065W	729 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	FES1	YBR101C	873 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	UBX5	YDR330W	1503 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	RTK1	YDL025C	1863 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	RDS1	YCR106W	2499 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	MEK1	YOR351C	1494 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	RAD5	YLR032W	3510 nt		3.47	□□□□□ -1.85
VIK1	Q12045	PDR12	YPL058C	4536 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	GLC3	YEL011W	2115 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	RPS8B	YER102W	603 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	YKL071W	YKL071W	771 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	YAL064W-B	YAL064W-B	381 nt		3.46	□□□□□ -1.86

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