Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMOD3Q0VAK6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMOD3Q0VAK6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMOD3Q0VAK6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms