Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE4CQ08493 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms