Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SRSF4Q08170 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SRSF4Q08170 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms