Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTN3Q08043 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTN3Q08043 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms