Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBQ06643 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBQ06643 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBQ06643 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBQ06643 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBQ06643 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBQ06643 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBQ06643 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBQ06643 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBQ06643 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBQ06643 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBQ06643 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBQ06643 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBQ06643 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBQ06643 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBQ06643 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBQ06643 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBQ06643 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBQ06643 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBQ06643 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBQ06643 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LTBQ06643 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBQ06643 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBQ06643 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBQ06643 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBQ06643 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBQ06643 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBQ06643 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LTBQ06643 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LTBQ06643 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBQ06643 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBQ06643 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBQ06643 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBQ06643 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBQ06643 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBQ06643 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBQ06643 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBQ06643 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBQ06643 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBQ06643 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBQ06643 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBQ06643 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBQ06643 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBQ06643 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBQ06643 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBQ06643 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBQ06643 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBQ06643 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBQ06643 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LTBQ06643 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBQ06643 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBQ06643 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBQ06643 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBQ06643 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBQ06643 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBQ06643 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBQ06643 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBQ06643 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBQ06643 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBQ06643 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBQ06643 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBQ06643 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBQ06643 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBQ06643 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBQ06643 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBQ06643 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LTBQ06643 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBQ06643 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBQ06643 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBQ06643 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBQ06643 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBQ06643 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBQ06643 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBQ06643 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBQ06643 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBQ06643 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBQ06643 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBQ06643 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBQ06643 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBQ06643 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBQ06643 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LTBQ06643 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBQ06643 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBQ06643 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBQ06643 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBQ06643 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBQ06643 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBQ06643 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBQ06643 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBQ06643 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBQ06643 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBQ06643 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBQ06643 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBQ06643 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBQ06643 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBQ06643 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBQ06643 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBQ06643 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBQ06643 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LTBQ06643 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms