Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSME1Q06323 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PSME1Q06323 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PSME1Q06323 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms