Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SRSF11Q05519 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SRSF11Q05519 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms