Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNEQ04844 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms