Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP4A11Q02928 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP4A11Q02928 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms