Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
TOP2BQ02880 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOP2BQ02880 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC36.69■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms