Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCNT1Q02742 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GCNT1Q02742 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCNT1Q02742 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms