Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSC2Q02487 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC2Q02487 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC2Q02487 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms