Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN2Q02246 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTN2Q02246 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN2Q02246 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms