Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
OTUD4Q01804 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD4Q01804 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms