Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EXOSC10Q01780 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC10Q01780 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXOSC10Q01780 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms