Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFITM3Q01628 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFITM3Q01628 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms