Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F1Q01094 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F1Q01094 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms