Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1BQ00975 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNA1BQ00975 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms