Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK17Q00537 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK17Q00537 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms