Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXC5Q00444 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms