Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR1P84550 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms