Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMF1P82094 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMF1P82094 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMF1P82094 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMF1P82094 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMF1P82094 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMF1P82094 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
TMF1P82094 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMF1P82094 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMF1P82094 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMF1P82094 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMF1P82094 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMF1P82094 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TMF1P82094 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMF1P82094 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TMF1P82094 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMF1P82094 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMF1P82094 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMF1P82094 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMF1P82094 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMF1P82094 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMF1P82094 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMF1P82094 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TMF1P82094 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TMF1P82094 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMF1P82094 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMF1P82094 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMF1P82094 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMF1P82094 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMF1P82094 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMF1P82094 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMF1P82094 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMF1P82094 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TMF1P82094 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TMF1P82094 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMF1P82094 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMF1P82094 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMF1P82094 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMF1P82094 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMF1P82094 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TMF1P82094 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TMF1P82094 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMF1P82094 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMF1P82094 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMF1P82094 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMF1P82094 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMF1P82094 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TMF1P82094 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMF1P82094 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TMF1P82094 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TMF1P82094 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TMF1P82094 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TMF1P82094 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TMF1P82094 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TMF1P82094 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMF1P82094 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMF1P82094 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMF1P82094 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TMF1P82094 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TMF1P82094 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TMF1P82094 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TMF1P82094 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TMF1P82094 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
TMF1P82094 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TMF1P82094 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TMF1P82094 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TMF1P82094 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TMF1P82094 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TMF1P82094 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMF1P82094 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMF1P82094 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMF1P82094 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMF1P82094 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMF1P82094 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMF1P82094 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMF1P82094 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMF1P82094 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMF1P82094 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMF1P82094 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMF1P82094 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMF1P82094 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMF1P82094 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMF1P82094 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMF1P82094 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TMF1P82094 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMF1P82094 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMF1P82094 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMF1P82094 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMF1P82094 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TMF1P82094 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMF1P82094 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMF1P82094 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMF1P82094 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMF1P82094 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMF1P82094 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMF1P82094 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMF1P82094 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMF1P82094 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TMF1P82094 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMF1P82094 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms