Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SSBP2P81877 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP2P81877 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms