Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX1P78414 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX1P78414 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX1P78414 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX1P78414 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRX1P78414 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX1P78414 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX1P78414 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRX1P78414 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRX1P78414 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRX1P78414 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX1P78414 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX1P78414 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX1P78414 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX1P78414 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX1P78414 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX1P78414 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX1P78414 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX1P78414 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRX1P78414 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX1P78414 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX1P78414 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX1P78414 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX1P78414 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX1P78414 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX1P78414 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX1P78414 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX1P78414 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX1P78414 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX1P78414 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX1P78414 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX1P78414 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX1P78414 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX1P78414 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX1P78414 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX1P78414 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX1P78414 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRX1P78414 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX1P78414 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX1P78414 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX1P78414 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX1P78414 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX1P78414 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX1P78414 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX1P78414 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX1P78414 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX1P78414 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX1P78414 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX1P78414 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX1P78414 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX1P78414 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX1P78414 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX1P78414 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRX1P78414 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX1P78414 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX1P78414 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX1P78414 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX1P78414 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX1P78414 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX1P78414 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX1P78414 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX1P78414 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX1P78414 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX1P78414 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX1P78414 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX1P78414 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX1P78414 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX1P78414 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX1P78414 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX1P78414 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRX1P78414 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX1P78414 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX1P78414 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX1P78414 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX1P78414 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX1P78414 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRX1P78414 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX1P78414 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX1P78414 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX1P78414 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX1P78414 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX1P78414 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX1P78414 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX1P78414 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX1P78414 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX1P78414 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX1P78414 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX1P78414 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX1P78414 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX1P78414 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX1P78414 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX1P78414 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRX1P78414 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
IRX1P78414 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX1P78414 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX1P78414 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX1P78414 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX1P78414 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX1P78414 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX1P78414 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms