Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT85P78386 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT85P78386 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT85P78386 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT85P78386 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT85P78386 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT85P78386 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT85P78386 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT85P78386 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT85P78386 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT85P78386 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT85P78386 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT85P78386 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT85P78386 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT85P78386 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT85P78386 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT85P78386 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT85P78386 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT85P78386 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT85P78386 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT85P78386 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT85P78386 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT85P78386 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT85P78386 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT85P78386 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT85P78386 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT85P78386 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT85P78386 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT85P78386 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT85P78386 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT85P78386 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT85P78386 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT85P78386 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT85P78386 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT85P78386 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT85P78386 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT85P78386 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT85P78386 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT85P78386 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT85P78386 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT85P78386 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT85P78386 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT85P78386 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT85P78386 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT85P78386 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT85P78386 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT85P78386 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT85P78386 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT85P78386 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT85P78386 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT85P78386 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT85P78386 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT85P78386 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT85P78386 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT85P78386 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT85P78386 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT85P78386 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT85P78386 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT85P78386 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT85P78386 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT85P78386 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT85P78386 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT85P78386 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT85P78386 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT85P78386 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT85P78386 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT85P78386 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT85P78386 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT85P78386 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT85P78386 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT85P78386 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT85P78386 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT85P78386 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT85P78386 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT85P78386 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT85P78386 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT85P78386 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT85P78386 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT85P78386 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT85P78386 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT85P78386 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT85P78386 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT85P78386 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT85P78386 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT85P78386 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT85P78386 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT85P78386 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT85P78386 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT85P78386 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT85P78386 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT85P78386 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT85P78386 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT85P78386 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT85P78386 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT85P78386 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT85P78386 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT85P78386 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT85P78386 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT85P78386 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT85P78386 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms