Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC1P78348 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms