Protein–RNA interactions for Protein: P62955

CACNG7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG7P62955 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNG7P62955 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms