Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL23P62829 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL23P62829 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL23P62829 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL23P62829 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL23P62829 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL23P62829 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL23P62829 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL23P62829 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL23P62829 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL23P62829 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL23P62829 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL23P62829 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL23P62829 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL23P62829 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL23P62829 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL23P62829 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL23P62829 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL23P62829 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL23P62829 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL23P62829 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL23P62829 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL23P62829 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL23P62829 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL23P62829 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL23P62829 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL23P62829 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL23P62829 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL23P62829 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL23P62829 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL23P62829 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL23P62829 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL23P62829 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL23P62829 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL23P62829 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL23P62829 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL23P62829 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL23P62829 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL23P62829 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL23P62829 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL23P62829 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL23P62829 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL23P62829 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL23P62829 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL23P62829 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL23P62829 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL23P62829 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL23P62829 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL23P62829 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL23P62829 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL23P62829 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL23P62829 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL23P62829 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL23P62829 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL23P62829 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL23P62829 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL23P62829 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL23P62829 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL23P62829 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL23P62829 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL23P62829 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL23P62829 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL23P62829 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL23P62829 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL23P62829 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL23P62829 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL23P62829 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL23P62829 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL23P62829 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL23P62829 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL23P62829 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL23P62829 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL23P62829 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL23P62829 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL23P62829 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL23P62829 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL23P62829 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL23P62829 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL23P62829 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL23P62829 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL23P62829 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL23P62829 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL23P62829 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL23P62829 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL23P62829 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL23P62829 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL23P62829 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL23P62829 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL23P62829 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL23P62829 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL23P62829 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL23P62829 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL23P62829 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL23P62829 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL23P62829 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL23P62829 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPL23P62829 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL23P62829 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL23P62829 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL23P62829 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms