Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SNRPD3P62318 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNRPD3P62318 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms