Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRP54P61011 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRP54P61011 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRP54P61011 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRP54P61011 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRP54P61011 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRP54P61011 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRP54P61011 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRP54P61011 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRP54P61011 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRP54P61011 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRP54P61011 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRP54P61011 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRP54P61011 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SRP54P61011 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRP54P61011 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRP54P61011 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRP54P61011 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRP54P61011 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SRP54P61011 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRP54P61011 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SRP54P61011 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRP54P61011 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRP54P61011 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRP54P61011 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRP54P61011 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRP54P61011 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRP54P61011 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRP54P61011 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRP54P61011 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRP54P61011 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRP54P61011 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRP54P61011 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRP54P61011 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRP54P61011 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRP54P61011 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRP54P61011 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRP54P61011 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRP54P61011 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRP54P61011 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRP54P61011 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRP54P61011 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRP54P61011 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRP54P61011 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRP54P61011 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRP54P61011 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRP54P61011 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRP54P61011 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRP54P61011 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRP54P61011 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRP54P61011 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRP54P61011 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRP54P61011 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRP54P61011 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRP54P61011 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP54P61011 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP54P61011 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP54P61011 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP54P61011 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP54P61011 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP54P61011 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP54P61011 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP54P61011 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP54P61011 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP54P61011 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP54P61011 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP54P61011 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP54P61011 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP54P61011 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP54P61011 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP54P61011 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP54P61011 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP54P61011 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP54P61011 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP54P61011 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP54P61011 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP54P61011 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP54P61011 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP54P61011 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRP54P61011 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP54P61011 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP54P61011 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP54P61011 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP54P61011 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP54P61011 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP54P61011 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP54P61011 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP54P61011 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP54P61011 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP54P61011 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP54P61011 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP54P61011 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP54P61011 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP54P61011 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP54P61011 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP54P61011 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP54P61011 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP54P61011 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP54P61011 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP54P61011 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms