Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTBP60709 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTBP60709 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTBP60709 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTBP60709 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTBP60709 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTBP60709 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTBP60709 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTBP60709 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTBP60709 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTBP60709 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTBP60709 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTBP60709 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTBP60709 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTBP60709 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTBP60709 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTBP60709 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTBP60709 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTBP60709 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTBP60709 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTBP60709 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTBP60709 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTBP60709 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTBP60709 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTBP60709 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTBP60709 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTBP60709 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTBP60709 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTBP60709 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTBP60709 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTBP60709 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTBP60709 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTBP60709 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTBP60709 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTBP60709 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTBP60709 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTBP60709 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTBP60709 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ACTBP60709 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTBP60709 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTBP60709 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTBP60709 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTBP60709 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTBP60709 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTBP60709 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTBP60709 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTBP60709 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTBP60709 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ACTBP60709 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTBP60709 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTBP60709 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTBP60709 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTBP60709 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTBP60709 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTBP60709 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTBP60709 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTBP60709 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTBP60709 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTBP60709 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTBP60709 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTBP60709 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTBP60709 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTBP60709 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ACTBP60709 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTBP60709 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTBP60709 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTBP60709 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTBP60709 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTBP60709 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTBP60709 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTBP60709 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTBP60709 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTBP60709 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTBP60709 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTBP60709 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTBP60709 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTBP60709 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTBP60709 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTBP60709 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTBP60709 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTBP60709 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTBP60709 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTBP60709 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTBP60709 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTBP60709 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTBP60709 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTBP60709 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTBP60709 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTBP60709 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTBP60709 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTBP60709 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTBP60709 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTBP60709 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTBP60709 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTBP60709 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTBP60709 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTBP60709 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTBP60709 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTBP60709 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTBP60709 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms