Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DCDC1P59894 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DCDC1P59894 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms