Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RHBDL3P58872 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHBDL3P58872 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHBDL3P58872 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms