Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA9P57773 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA9P57773 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA9P57773 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA9P57773 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA9P57773 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA9P57773 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA9P57773 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA9P57773 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA9P57773 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA9P57773 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA9P57773 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA9P57773 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA9P57773 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA9P57773 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA9P57773 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA9P57773 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA9P57773 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA9P57773 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA9P57773 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA9P57773 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA9P57773 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA9P57773 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA9P57773 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA9P57773 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA9P57773 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA9P57773 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA9P57773 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA9P57773 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA9P57773 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA9P57773 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA9P57773 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA9P57773 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA9P57773 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA9P57773 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA9P57773 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA9P57773 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA9P57773 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA9P57773 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA9P57773 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA9P57773 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA9P57773 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA9P57773 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA9P57773 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA9P57773 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GJA9P57773 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GJA9P57773 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GJA9P57773 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA9P57773 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA9P57773 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA9P57773 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA9P57773 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA9P57773 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA9P57773 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA9P57773 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA9P57773 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA9P57773 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GJA9P57773 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA9P57773 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA9P57773 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA9P57773 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA9P57773 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA9P57773 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA9P57773 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA9P57773 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA9P57773 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA9P57773 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GJA9P57773 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA9P57773 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA9P57773 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA9P57773 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA9P57773 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA9P57773 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA9P57773 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA9P57773 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA9P57773 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA9P57773 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA9P57773 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJA9P57773 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA9P57773 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA9P57773 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA9P57773 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA9P57773 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA9P57773 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA9P57773 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA9P57773 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA9P57773 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA9P57773 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA9P57773 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA9P57773 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA9P57773 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA9P57773 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA9P57773 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA9P57773 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA9P57773 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA9P57773 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJA9P57773 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA9P57773 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA9P57773 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJA9P57773 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms