Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN2P57739 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN2P57739 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms