Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF3P57682 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF3P57682 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF3P57682 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF3P57682 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF3P57682 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF3P57682 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF3P57682 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KLF3P57682 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KLF3P57682 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KLF3P57682 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF3P57682 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF3P57682 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF3P57682 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF3P57682 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF3P57682 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF3P57682 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF3P57682 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF3P57682 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF3P57682 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF3P57682 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF3P57682 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF3P57682 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF3P57682 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF3P57682 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF3P57682 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF3P57682 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF3P57682 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KLF3P57682 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF3P57682 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF3P57682 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF3P57682 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF3P57682 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF3P57682 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF3P57682 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF3P57682 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF3P57682 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF3P57682 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF3P57682 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF3P57682 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF3P57682 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF3P57682 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KLF3P57682 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLF3P57682 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF3P57682 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF3P57682 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF3P57682 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF3P57682 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF3P57682 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF3P57682 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF3P57682 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF3P57682 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLF3P57682 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF3P57682 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF3P57682 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF3P57682 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF3P57682 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF3P57682 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF3P57682 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF3P57682 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF3P57682 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF3P57682 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLF3P57682 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF3P57682 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF3P57682 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF3P57682 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF3P57682 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF3P57682 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF3P57682 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF3P57682 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF3P57682 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF3P57682 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF3P57682 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF3P57682 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF3P57682 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF3P57682 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLF3P57682 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms