Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTSWP56202 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTSWP56202 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTSWP56202 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTSWP56202 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTSWP56202 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTSWP56202 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTSWP56202 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTSWP56202 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTSWP56202 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CTSWP56202 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CTSWP56202 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTSWP56202 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTSWP56202 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTSWP56202 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTSWP56202 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CTSWP56202 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTSWP56202 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTSWP56202 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTSWP56202 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTSWP56202 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTSWP56202 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTSWP56202 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTSWP56202 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTSWP56202 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTSWP56202 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTSWP56202 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTSWP56202 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTSWP56202 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTSWP56202 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CTSWP56202 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTSWP56202 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTSWP56202 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTSWP56202 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTSWP56202 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CTSWP56202 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTSWP56202 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTSWP56202 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTSWP56202 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTSWP56202 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTSWP56202 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTSWP56202 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTSWP56202 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTSWP56202 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTSWP56202 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTSWP56202 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTSWP56202 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTSWP56202 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTSWP56202 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTSWP56202 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTSWP56202 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTSWP56202 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTSWP56202 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTSWP56202 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTSWP56202 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTSWP56202 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTSWP56202 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTSWP56202 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTSWP56202 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTSWP56202 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTSWP56202 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTSWP56202 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTSWP56202 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTSWP56202 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTSWP56202 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CTSWP56202 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTSWP56202 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CTSWP56202 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTSWP56202 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CTSWP56202 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CTSWP56202 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTSWP56202 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTSWP56202 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTSWP56202 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTSWP56202 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTSWP56202 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTSWP56202 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTSWP56202 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTSWP56202 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTSWP56202 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTSWP56202 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTSWP56202 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTSWP56202 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTSWP56202 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CTSWP56202 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTSWP56202 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTSWP56202 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTSWP56202 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTSWP56202 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTSWP56202 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTSWP56202 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTSWP56202 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTSWP56202 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTSWP56202 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTSWP56202 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTSWP56202 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTSWP56202 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTSWP56202 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTSWP56202 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTSWP56202 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms