Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLTPP55058 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLTPP55058 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLTPP55058 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLTPP55058 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLTPP55058 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLTPP55058 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLTPP55058 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLTPP55058 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PLTPP55058 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLTPP55058 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLTPP55058 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLTPP55058 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLTPP55058 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLTPP55058 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLTPP55058 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLTPP55058 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLTPP55058 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLTPP55058 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLTPP55058 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLTPP55058 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLTPP55058 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLTPP55058 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLTPP55058 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLTPP55058 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLTPP55058 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLTPP55058 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLTPP55058 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLTPP55058 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLTPP55058 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLTPP55058 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLTPP55058 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLTPP55058 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PLTPP55058 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLTPP55058 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLTPP55058 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLTPP55058 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLTPP55058 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLTPP55058 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLTPP55058 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLTPP55058 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLTPP55058 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLTPP55058 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLTPP55058 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLTPP55058 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLTPP55058 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLTPP55058 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLTPP55058 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLTPP55058 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLTPP55058 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLTPP55058 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLTPP55058 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PLTPP55058 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLTPP55058 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLTPP55058 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLTPP55058 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PLTPP55058 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLTPP55058 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLTPP55058 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLTPP55058 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLTPP55058 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLTPP55058 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLTPP55058 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLTPP55058 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PLTPP55058 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLTPP55058 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLTPP55058 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLTPP55058 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLTPP55058 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLTPP55058 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLTPP55058 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PLTPP55058 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLTPP55058 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLTPP55058 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLTPP55058 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLTPP55058 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLTPP55058 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLTPP55058 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLTPP55058 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLTPP55058 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLTPP55058 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLTPP55058 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLTPP55058 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLTPP55058 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLTPP55058 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLTPP55058 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLTPP55058 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLTPP55058 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLTPP55058 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLTPP55058 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLTPP55058 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLTPP55058 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLTPP55058 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLTPP55058 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLTPP55058 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLTPP55058 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLTPP55058 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLTPP55058 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLTPP55058 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLTPP55058 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms