Protein–RNA interactions for Protein: P55056

APOC4, Apolipoprotein C-IV, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4P55056 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4P55056 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4P55056 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4P55056 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4P55056 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4P55056 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4P55056 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4P55056 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4P55056 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4P55056 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4P55056 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4P55056 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4P55056 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4P55056 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4P55056 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4P55056 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4P55056 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4P55056 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4P55056 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4P55056 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4P55056 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4P55056 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4P55056 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4P55056 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4P55056 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4P55056 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4P55056 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4P55056 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4P55056 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4P55056 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4P55056 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4P55056 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4P55056 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4P55056 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4P55056 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4P55056 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4P55056 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4P55056 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4P55056 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4P55056 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4P55056 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4P55056 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4P55056 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4P55056 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4P55056 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4P55056 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4P55056 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4P55056 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4P55056 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4P55056 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4P55056 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4P55056 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOC4P55056 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4P55056 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4P55056 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4P55056 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4P55056 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4P55056 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4P55056 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4P55056 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4P55056 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4P55056 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4P55056 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4P55056 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4P55056 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4P55056 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4P55056 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4P55056 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4P55056 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4P55056 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4P55056 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4P55056 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4P55056 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4P55056 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4P55056 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms