Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB3P54753 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHB3P54753 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms