Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD23BP54727 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms